生信分析FAQ汇总

• • 检测多糖分子量的分布情况时，动态光散射（DLS）分析的时候需要用到标准品么？

  在进行DLS分析时，虽然标准品不是必须的，但在实验校准和数据对比方面，它们有助于提高分析的准确性和可靠性。

• • 生物药二硫键/游离半胱氨酸检测对细胞量的要求是什么？

  在生物药中检测二硫键和游离半胱氨酸的过程中，细胞量的要求取决于多个因素，包括分析方法的灵敏度、目标蛋白的表达水平、以及所需的检测精度。

• • KEGG差异物质分析做完之后怎么从我关注的通路中找关键代谢物呢？

  在KEGG差异物质分析之后，找到关注通路中的关键代谢物是非常重要的步骤，尤其在理解生物系统的功能和发现潜在的生物标志物时。以下是一个参考思路，逐步帮助你找到关键代谢物。

• • 请问什么网站可以比对抗体可变区重、轻链序列呀？

  要比对抗体可变区的重链和轻链序列，可以使用一些专业的生物信息学工具和数据库。这些平台不仅能帮助你进行序列比对，还能提供抗体相关的结构和功能信息。这里介绍几个常用的网站和工具。

• • 鉴定完肽序列后怎么确定肽段是属于哪一种前体蛋白？或者说用什么软件可以分析？

  鉴定肽序列后，可以通过在已知蛋白质数据库中进行匹配搜索，并利用Mascot、Proteome Discoverer、MaxQuant、PEAKS和Sequest等生物信息学软件，结合适当的匹配和过滤参数，来确定肽段所属的前体蛋白，并通过多种工具和实验验证结果以确保鉴定的准确性和可靠性。

• • KEGG差异代谢产物通路分析如何去确定富集到这个通

  在KEGG差异代谢产物通路分析中，通过高通量测序筛选出差异表达的基因，并进行通路富集分析。结合文献和数据库资料以及实验验证，确认这些基因在通路中的作用。使用分析工具和动态模型评估基因表达变化对通路的影响，并通过实验数据进行验证。综合考虑上下游基因与代谢物的关系，结合多组学数据和具体的生物学背

• • 请问我的蛋白组kegg富集p值全大于0.1，请问我

  在蛋白组KEGG富集分析中，若P值全大于0.1，可通过增加样本数量、提高数据质量、选择合适的背景数据库、尝试不同统计方法、调整显著性阈值，并结合多组学数据进行综合分析和可视化，来提高检测敏感性和结果显著性。

• • 为什么我的kegg都是疾病而不是通路？

  KEGG搜索结果显示疾病而不是通路，可能有以下原因，你可以重新检查这些方面来解决问题。1.查询关键词：如果你的输入关键词中包含了大量与疾病相关的基因或蛋白质，那么在KEGG分析中可能会更容易匹配到疾病相关的通路和条目。比如，如果你的数据集来自肿瘤样本，那么这些基因很可能与癌症相关的通路关联更

• • 化学计量法，主成分分析、偏最小二乘怎么绘图？不用编程的方法

  要进行化学计量学中的主成分分析（PCA）和偏最小二乘回归（PLS）的绘图，而不使用编程，你可以选择使用专业的数据分析软件，如 Origin 或 Minitab，这些软件提供直观的用户界面和丰富的图形选项。以下是使用这类软件的基本步骤：   一、使用 Origin 绘制 PCA 和 PLS 图

• • 我想询问化学计量法，主成分分析、偏最小二乘的原理以及怎么绘图？

  在化学计量学中，主成分分析（PCA）和偏最小二乘回归（PLS）都是关键的数据分析工具。以下是这两种技术的原理和绘图方法：一、主成分分析（PCA）1. 原理：PCA 通过正交变换将可能相关的变量转换为一组线性不相关的变量，称为主成分。它的目标是找出数据中方差最大的方向，并在这些方向上投影数据，