单细胞蛋白质组学分析服务

单细胞蛋白质组学（Single-cell proteomics）分析是对组织解离得到的单个细胞进行蛋白质组学分析，包括单个细胞内蛋白质的组成、丰度和修饰状态等。相比常规的蛋白质组学研究，单细胞蛋白质组学的优势是能够得到单个细胞的信息，进行细胞类型特异性差异表达分析，为细胞异质性、生物系统复杂性和疾病机制提供革命性的见解，从而在更精细的水平上研究细胞行为和功能，高度适用于癌症研究、免疫学、发育生物学等。

 



单细胞蛋白组（Nat Methods 20, 324–326 (2023).）

 

细胞是目前我们所发现的生物体基本的结构和功能单位，也是一切生命活动的基础。在多细胞生物中，细胞间变异性至关重要，比如，肿瘤由多种细胞类型组成，包括癌细胞、成纤维细胞、免疫细胞和内皮细胞，每种细胞类型又由多个不同的细胞群组成。它们之间的密切相互作用通常会诱导肿瘤微环境中的细胞转化以支持肿瘤生长。由于细胞的高度异质性，传统水平蛋白质组学无法体现这些细微的差异，想探究特异性细胞亚群对癌症的发生发展、转移、免疫逃逸起到的作用，或者探究亚群的基因或蛋白寻找癌症质量创新靶点，都需要进行单细胞蛋白质组学分析。

 



肿瘤微环境（Cancer Discov (2021) 11 (4): 933-959.）

 

百泰派克生物科技单细胞蛋白质组学分析服务

百泰派克生物科技基于Thermo最先进的Orbitrap Astral高分辨质谱仪以及Bruker的timsTOF HT设备，并配备全流程集成自动化的单细胞分选平台CellenONE，搭建了尖端的单细胞蛋白质组学分析平台，在高生物样本异质性的情况下实现精确的单细胞蛋白质组学稳定检测分析：

 

• 分选温和：采用压电声学分配技术，具有更低的剪切应力和损耗率，及更高的细胞存活率；
• 光学监控：采用高级视觉处理技术，通过软件集成的可视反馈自动判断后续分选操作；成功率高；
• 损失率低：单细胞分离率达98%，含多个细胞的液滴将回收用于再次分配；全流程的自动化；

 

分选得到的单细胞使用基本无损的蛋白前处理方法酶切，得到的肽段使用最新的，高灵敏度的Thermo Orbitrap Astral设备上机检测，保证数据质量，确保客户获得最全面的单细胞蛋白质组学图谱。

 



单细胞蛋白质组学分析流程

 

单细胞蛋白质组学分析优势

在过去的十年中，对大量单细胞进行的常规单细胞RNA测序极大地提高了我们对复杂生物系统潜在异质性的理解。技术进步也使蛋白质测量成为可能，有助于进一步阐明复杂组织中存在的细胞类型和状态。相比较单细胞转录组分析来说，做单细胞蛋白组学分析有更多的优势：

 

1. 与蛋白的相关性更高：bulk水平转录信息与蛋白之间的相关性约0.5，单细胞水平的相关性仅0.2左右（Mol Syst Biol (2022)18: e10798）

 

2. 体现蛋白翻译后修饰信息：PTM极大的丰富了蛋白种类，调节蛋白功能，这部分信息在mRNA中并没有体现

 

3. 机制不同：mRNA的表达调节和蛋白的活性调节是不同的机制，转录本的变异与蛋白结果，没有良好的相关性，两个数据可以起到互补作用

 

4. 蛋白的结果比较稳定，更接近真实细胞水平的表达谱：蛋白质的视角来解决细胞之间的异质性和个体之间的差异，从而发现细胞状态差异，细胞组成的改变，揭示生理病理现象，帮助寻找新的治疗靶点（Mol Cell. 2022;82(12):2335-2349）

 



蛋白与转录相关性（Cell Rep. 2023;42(11):113455.）

 

单细胞蛋白组学分析应用

医学领域：

1. 肿瘤异质性研究

2. 胚胎发育生物学研究

3. 免疫治疗临床实验

4. 靶点药开发

5. 免疫机制研究

6. 耐药与动力学研究

7. 干细胞分化潜能研究

8. 细胞图谱绘制

9. 精准病理检测等

 

农学领域：

1. 细胞特异的信号响应机制

2. 植物发育单细胞图谱

3. 胁迫抗逆

4. 品种单细胞修饰特征

5. 细胞动态和调控网络

6. 植物再生机制等

 

结果示例

 



 

中/英文项目报告

在技术报告中，百泰派克生物科技会为您提供详细的中英文双语版技术报告，报告包括：

1. 实验步骤（中英文）
2. 相关的质谱参数（中英文）
3. 质谱图片
4. 原始数据
5. 单细胞蛋白质分析详细信息

 

单细胞蛋白质组学分析一站式服务

您只需下单-寄送样品

百泰派克一站式服务完成：样品处理-上机分析-数据分析-项目报告

 

 

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