完成待测物鉴定后，怎么去把它归属到不同的种类呢?即怎么批量查询这些代谢物属于什么种类？

在完成待测物鉴定后，将其归属到不同的种类（如脂类、氨基酸、糖类等）是代谢组学数据分析的重要步骤。为了实现批量查询，可以结合代谢物分类数据库和自动化工具来高效完成。以下是推荐的步骤和方法：

 

一、确定代谢物鉴定结果格式

确认代谢物信息是否包含名称（如Glucose）、分子式（如C6H12O6）、或标识符（如CAS号、KEGG编号、HMDB编号、PubChem CID）。

如果信息格式化明确，后续分类将更加高效。

 

二、使用代谢物分类数据库

可以利用以下数据库进行代谢物分类：

1、Human Metabolome Database (HMDB)

• 提供详细的化学和生物功能分类。
• 使用“Batch Search”工具批量上传代谢物名称或编号，获取分类结果。

 

2、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)

• 提供化学分类和代谢通路信息。
• 使用KEGG Mapper的“Compound Search”功能查询代谢物分类。

 

3、ClassyFire

• 基于分子结构的化学分类平台。
• 输入SMILES或InChI等格式信息，批量获取详细的化学类别。

 

4、PubChem

• 综合性化学数据库，支持代谢物属性查询。
• 批量输入CID号，获取整理好的分类信息。

 

三、自动化处理工具

为了实现高效批量查询，可以借助以下工具：

1、MetaboAnalyst

2、R语言或Python的代谢物分析

3、Excel结合批量API查询

 

推荐根据数据格式选择适合的数据库进行批量查询，并结合自动化工具提高效率。北京百泰派克生物科技有限公司提供代谢组学分析的一站式服务，可帮助快速完成待测物分类，欢迎免费咨询！

 

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