多组学分析FAQ汇总

• • 三代全长转录组测序与RNA-seq有什么区别呀？

  三代全长转录组测序与RNA-seq是两种常用的转录组测序技术，它们在测序原理、应用范围和数据分析等方面存在一些区别。下面我将详细解答你的问题，并逐步解释这两种技术的区别。 1.测序原理： 三代全长转录组测序：三代测序技术主要包括PacBio SMRT（Single Molecule Re

• • 转录组测序和RNA seq的区别？

  转录组测序（transcriptome sequencing）是一种利用高通量测序技术来研究转录组的方法，也就是说，它可以用来测定一个特定生物或细胞类型的所有RNA分子。而RNA测序（RNA-seq）是转录组测序的一种，是一种利用深度测序技术特异性地研究转录组中的mRNA（信使RNA）水平的

• • 跟大家请教一个问题，我的实验材料是花，做转录组、蛋白组测序取样该分离还是整花？

  是否需要分离植物花的各个部分或使用整花进行转录组和蛋白组测序，这完全取决于研究的具体目标。 如果研究的目的是了解整个花朵的基因表达和蛋白质组成，那么可以使用整花进行取样。这样做简化了取样过程，并能提供一个全面的、整体的视角。 如果研究的目的是探索特定花朵部分（如花瓣、雄蕊、雌蕊等）中的基

• • 多组学分析有哪些思路？

  多组学分析是一种综合利用多种高通量技术和数据分析方法来研究生物系统的方法。它可以帮助我们全面了解生物系统的复杂性和多样性，揭示基因、蛋白质、代谢物等分子之间的相互作用和调控网络。在生物药物领域，多组学分析可以用于药物研发的各个环节，包括药物靶点的发现、药物作用机制的解析、药物剂量的优化等。以

• • 多组学分析可以揭示微生物互作对微生物群落的影响吗？

  多组学分析可以揭示微生物互作对微生物群落的影响。 多组学分析可以通过整合不同层面的数据，提供全面的视角来研究微生物互作对微生物群落的影响。例如，通过基因组学分析可以了解微生物的基因组组成和功能潜力，从而推测其在微生物群落中的作用。转录组学分析可以揭示微生物在特定环境中的基因表达模式，进一步

• • 转录组和什么组学联合较好？

  选择与转录组学结合的组学类型应该基于你的研究目标、可用资源、以及你希望回答的科学问题。以下是几个常见的选择及其独特的优势： 1.转录组学与基因组学的联合： 如果你的研究涉及到个体间的基因差异，以及这些差异如何影响表型，基因组学可能是一个重要的领域。特别是在研究遗传疾病或个体对药物反应的差异

• • 请问有人知道转录组动物取样的步骤吗？跟代谢组一样吗？取好的脂肪组织需要放在PBS中洗去血丝和毛吗？

  转录组学和代谢组学的取样步骤有所不同，因为它们分别旨在分析不同类型的生物分子——转录组学分析RNA，而代谢组学分析细胞或组织中的代谢物。尽管两者都需要高质量的样本以确保准确的数据分析，但是样本的处理和保存方法因分析的目标分子而异。 转录组学和代谢组学在动物取样时的一般考虑因素和步骤如下：

• • 做完转录组测序后，只做了差异基因分析，不做KEGG与GO分析，该如何进行后续？

  当做完转录组测序后，只进行了差异基因分析而没有进行KEGG与GO分析，可以考虑以下几个后续步骤： 1.确定差异基因的生物学意义： 首先，需要对差异基因进行生物学意义的解读。通过查阅相关文献和数据库，了解这些差异基因在生物学过程中的功能和调控作用。这可以帮助我们理解差异基因的潜在生物学意义，

• • 请问宏转录组的差异表达基因分析和差异表达通路分析如何进行？

  进行宏转录组的差异表达基因分析和差异表达通路分析时，可以按照以下步骤进行： 1.数据预处理： 对原始测序数据进行质量控制，包括去除低质量的reads和去除接头序列等。 使用比对工具将清洗后的reads比对到参考基因组或转录组上，得到比对结果。 2.差异表达基因分析： 使用比对结果计

• • 常规样本与石蜡包埋样本全转录组测序，数据质量是否不同？

  常规样本（如新鲜冻存的组织或细胞）和石蜡包埋样本（如福尔马林固定石蜡包埋，FFPE）的全转录组测序确实在数据质量上可能存在差异。这些差异主要是由样本处理、保存方法以及RNA的提取和质量等因素造成的。 一、RNA的完整性： 1.常规样本： 通常来自新鲜或快速冻结的组织，其中的RNA更完整，