请问有人知道转录组动物取样的步骤吗?跟代谢组一样吗?取好的脂肪组织需要放在PBS中洗去血丝和毛吗?
转录组学和代谢组学的取样步骤有所不同,因为它们分别旨在分析不同类型的生物分子——转录组学分析RNA,而代谢组学分析细胞或组织中的代谢物。尽管两者都需要高质量的样本以确保准确的数据分析,但是样本的处理和保存方法因分析的目标分子而异。
转录组学和代谢组学在动物取样时的一般考虑因素和步骤如下:
一、转录组学:
1.取样:
取下特定的组织(例如脂肪组织),尽量减少因操纵而造成的应激或其他变化,因为这些可能影响基因表达。
2.清洗:
可以用PBS(磷酸盐缓冲盐水)轻轻清洗组织表面的血丝和污物,但要避免对组织造成机械性损伤。
3.处理:
为了防止RNA降解,取样后组织应立即置于适当的RNA稳定剂中(例如RNAlater),或立即通过液氮快速冷冻,然后存储在-80°C的条件下,直到提取RNA。
二、代谢组学:
1.取样:
同样需要取下特定的组织,过程中要快速且减少污染。
2.清洗:
代谢组学的样本通常不需要像转录组学那样清洗,因为代谢物分析更关注组织中的化学成分,而非基于RNA的测量。但是,需要根据特定研究的目标和要求来确定。
3.处理:
组织通常需要通过液氮快速冷冻,然后在-80°C下储存,以保护组织中的代谢物不发生变化,直到进行代谢物提取和分析。
对于脂肪组织来说,如果目标是转录组学分析,清除血丝是有必要的,因为血液中的细胞和RNA可以污染组织样本,影响后续的RNA提取和基因表达分析。使用PBS清洗组织可以帮助去除血丝和污染物,但这个步骤应该快速且温和,以避免损伤组织或改变其基因表达。在处理和储存样本时,迅速并且避免RNA降解是至关重要的。
百泰派克生物科技——生物制品表征,多组学生物质谱检测优质服务商
相关服务:
How to order?