多组学分析FAQ汇总

• • RNA-Seq使用哪些测序平台？

  标准（Standard）、链特异性（Strand-Specific）、单细胞（Single-Cell）、小型（Small）和超低输入（Ultra-Low Input）RNA-Seq在Illumina平台上使用短读测序，例如NovaSeq和HiSeq。Iso-Seq在PacBio Sequel

• • 基于Illumina的RNA-Seq与PacBio上的Iso-Seq相比如何？

  一般来说，当对定性终点感兴趣时，Iso-Seq优于Illumina方法，例如选择性剪接、选择性多聚腺苷酸化、基因组注释和新转录本检测。对于定量评估（例如，一个样本中转录本A与B的表达，或样本1与样本2中转录本C的表达），推荐使用短读方法，因为可以获得更多的读取次数。相关服务:多组学整合分析

• • 你们能从相同的总RNA样本中制备出小RNA库和标准RNA库吗?

  可以，如果提供足够的材料并且总RNA样本中含有小RNA。由于Standard RNA- seq和Small RNA- seq使用不同的文库制备方法，所以必须对总RNA样本进行拆分。相关服务:多组学整合分析

• • 转录组测序——你们保留样品多长时间?

  项目完成后我们保留样品1年。相关服务:多组学整合分析

• • 什么是多组学？

  多组学（multiple omics）为发现跨多个生物学层次的动力提供了一个综合视角。这种生物学分析方法将基因组数据与转录组学、表观遗传学和蛋白质组学等其他模式的数据相结合，以测量基因表达、基因激活和蛋白质水平。 多组学分析研究有助于更全面地了解正常发育、细胞反应和疾病的分子变化。使用综合组

• • 在转录组测序数据中，以下术语是什么意思？

  1.Total genes：这是指在样本中检测到的总基因数。基因是DNA上的特定区域，可以编码一个或多个蛋白质。 2.Total isogenes：这是指在样本中检测到的总同源基因数。同源基因（或被称为转录本）是来自同一基因的不同转录结果，这些结果可能因剪接、启动位点的

• • 转录组如何能够快速地挑选与我研究方向相关的差异基因，做qpcr验证呀？

  挑选与研究方向相关的差异基因进行qPCR验证，首先需要进行一系列的分析步骤来确定可能的候选基因。以下是一种可能的方法： 1.差异表达分析：在RNA-seq分析流程中，已经使用了如DESeq2，edgeR等工具进行了差异表达基因分析。这一步会得到一份差异表达基因的列表，这

• • 转录组测序数据处理求助：gene id如何转换成gene symbol?

  将转录组测序数据中的基因ID（例如ENSEMBL ID、RefSeq ID等）转换为基因符号（Gene Symbol）是生物信息学分析中常见的需求。以下是一些常用的方法和工具： 1.使用生物信息学工具包：可以使用一些生物信息学工具包进行转换，例如Bioconductor

• • 各位老师，请问宏转录组测序和转录组测序有什么区别？

  "宏转录组测序"和"转录组测序"这两个术语在科学文献中并未明确区分。然而，从名称来看，可以做出一些合理的推断。 "转录组测序"是用于测定特定时间点、特定条件下，生物体内所有RNA的序列和相对数量。这些信息可以帮助研究人员理解基因在何时何地以及如何被转录。 "宏转录

• • 如何完成RNA-seq的分析流程？

  RNA-seq（RNA测序）是一种使用高通量测序技术来研究整个细胞转录组（包括mRNA，ncRNA等）的方法。它可以用来研究在特定时间点和/或条件下，哪些基因被表达以及表达的程度。 以下是一个常规的RNA-seq分析的基本步骤，这个流程可能会根据具体的实验设计和分析目标