肽检测限是多少?在典型的蛋白质组学分析中可以检测到多少种蛋白质?
没有一个通用的数字可回答这个问题。可检测蛋白质的数量取决于样品的复杂性、蛋白质浓度的动态范围、可用材料和使用的 LC-MS 仪器等因素。单次质谱运行中可检测的蛋白质范围可以从几个蛋白质到几百或上千个不等。 当前最先进的质谱仪的一般检测极限在亚飞摩尔(sub-femtomol)和阿托摩尔(attomol )范围。 然而,肽的实际检测限会随着其在MS仪器中的所谓“飞行性(flyability)”而变化。肽的飞行能力取决肽序列长度和组成、电离效率和碎片特性等几个特性。通常,蛋白质的某些肽“飞”得很好,因此在结果中非常丰富,而其他肽倘若不能很好地离子化,则永远不会被检测到。
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