请问什么网站可以比对抗体可变区重、轻链序列呀？

要比对抗体可变区的重链和轻链序列，可以使用一些专业的生物信息学工具和数据库。这些平台不仅能帮助你进行序列比对，还能提供抗体相关的结构和功能信息。以下是几个常用的网站和工具：

 

1. IMGT (International ImMunoGeneTics Information System)

• 简介：IMGT/V-QUEST是一个专门用于分析和比对免疫球蛋白（Ig）和T细胞受体（TCR）序列的工具。IMGT/V-QUEST可以进行抗体重链和轻链可变区序列的比对，并提供详细的序列特征、V(D)J基因段的识别以及突变分析。
• 网址：IMGT/V-QUEST

 

2. NCBI BLAST

• 简介：这是NCBI专门用于免疫球蛋白和T细胞受体序列的BLAST工具。IgBLAST可以比对抗体可变区的重链和轻链序列，并提供相关的基因段信息。
• 网址：NCBI IgBLAST

 

3. Abysis

• 简介：这是一个抗体数据库和分析平台，提供了抗体序列的比对、注释以及结构预测等功能。你可以上传你的抗体序列，并与数据库中的抗体序列进行比对。
• 网址：Abysis

 

4. ANARCI

• 简介：该工具可用于对抗体和T细胞受体序列进行比对，并基于IMGT、Kabat和Chothia编号系统进行编号。它可以快速对抗体重链和轻链的可变区序列进行分析。
• 网址：ANARCI 

 

5. Clustal Omega

• 简介：通用的多重序列比对工具，可以用于比对抗体的重链和轻链序列。虽然它不是专门针对抗体设计的，但仍可以用于多重抗体序列的比对分析。
• 网址：Clustal Omega

 

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