请问KEGG注释怎么做?

    进行KEGG注释主要包括以下几个步骤:

     

    1.序列比对:

    将你的基因或蛋白质序列与KEGG数据库中的序列进行比对,通常使用BLAST工具。这一步骤是为了找出数据库中与你的样本序列相似的已知序列。

     

    2.识别KEGG Orthology(KO)号:

    通过序列比对结果,你可以将样本中的基因或蛋白质对应到特定的KO号。KO系统是KEGG中用于将基因分类到它们的功能类别的一种方法。

     

    3.路径映射:

    一旦有了KO号,就可以将这些KO号映射到KEGG的代谢或信号传导路径中。这一步是用来查看样本中的基因或蛋白质参与了哪些生物学过程或代谢路径。

     

    4.功能注释与分析:

    基于路径映射的结果,进行深入的生物学功能分析,解释样本中的基因或蛋白质如何与生物学功能、病理过程或代谢活动相关联。

     

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    相关服务:

    KEGG通路注释及富集分析

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