如何找到想要的通路？分析得出的通路：癌症通路、癌症中的中枢碳代谢等，疾病是贫血，要一个一个去搜通路？找出其中和造血有关的通路？

不用一个一个去搜通路，可以使用以下方法高效找到与贫血和造血相关的通路：

 

1. 使用通路富集分析工具

• DAVID: 上传差异表达基因列表，进行KEGG通路富集分析，重点关注与造血相关的通路。
• GSEA (Gene Set Enrichment Analysis): 输入基因表达数据，进行富集分析，找到与造血和贫血相关的通路。
• STRING: 输入基因或蛋白质列表，进行Pathway富集分析，查看显著相关的通路。

 

2. 数据库搜索

• KEGG: 直接搜索与“贫血”或“造血”相关的通路，如“红细胞生成”、“铁代谢”等。
• Reactome: 在Pathway Browser中搜索与贫血相关的通路。

 

3. 文献检索

• PubMed: 搜索关键词“贫血 通路”或“造血 通路”，找到相关文献并提取通路信息。
• GO (Gene Ontology): 使用GO enrichment analysis，找出与造血功能相关的生物过程。

 

直接相关的通路

以下是一些与贫血和造血直接相关的通路，您可以重点关注：

• Hematopoietic cell lineage
• Iron metabolism in erythropoiesis
• Erythropoietin signaling pathway
• HIF-1 signaling pathway
• JAK-STAT signaling pathway

 

百泰派克生物科技--生物制品表征，多组学生物质谱检测优质服务商

 

相关服务：

KEGG差异代谢产物通路分析

代谢组学数据质量评估

主成分分析（PCA）

PLS-DA/OPLS-DA二维图

数据归一化分析

单变量统计分析

差异代谢产物聚类分析