有已知的转录组数据，如何寻找未被研究过的未知基因？只能在文献中查找吗？

寻找未被研究过的未知基因有多种方法，不仅限于文献搜索。首先，可以通过比较已知转录组数据与公共数据库中的已知基因注释来识别未注释或未知基因。使用生物信息学工具和软件（如BLAST、Ensembl、NCBI或UCSC基因组浏览器）比对你的转录组数据，找出没有已知匹配项的序列。此外，利用专门的预测软件（如AUGUSTUS或GeneMark）可以帮助预测潜在的基因编码区域，进一步筛选可能的未知基因。

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