PLS-DA得分图（如下图）的标记代谢物怎么在图中标出来？

在PLS-DA（偏最小二乘判别分析）得分图中，通常会标记出对模型贡献最大或在统计上显著的代谢物。根据您提供的图像，标记的代谢物已经在图中以红色方框突出显示了。如果您需要进一步标出这些代谢物，通常的做法是使用专业的图形或统计软件，如R、Python或特定的生物信息学软件来进行编辑。

 

在图中标出代谢物的一般步骤：

1.确定代谢物：

首先，您需要确定哪些代谢物是重要的，通常基于P值、VIP值（变量重要性在投影中）或其他统计指标。

 

2.数据标注：

在数据集中标记这些代谢物，可能需要在您的数据中增加一个标识列，指明哪些点需要被标出。

 

3.图形编辑：

• 使用图形软件导入PLS-DA得分图。
• 根据需要标记的代谢物列表，找到它们对应的坐标点。
• 在这些点上放置标记，如高亮显示、加边框、改变颜色、增加标签或注释。

 

4.图例说明：

在图中增加图例，解释不同的标记代表的含义。



图1. PLS-DA 得分图示例

 

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