做酵母BY4741，库里只有酵母S288C，这个可以作为转录组测序的参考基因组嘛？

BY4741和S288C都是酵母Saccharomyces cerevisiae的常见实验菌株。S288C是酵母的参考菌株，它的基因组序列是最先被测定的，并且在很多基因组工具和数据库中被广泛使用作为参考。而BY4741是一个从S288C衍生出的haploid菌株，用于多种基因组学研究，包括基因敲除实验。

如果你要进行转录组测序（RNA-Seq）并需要一个参考基因组进行比对，S288C确实可以作为BY4741的参考基因组。实际上，当你在文献中查找关于BY4741的研究时，你会发现许多研究都使用S288C作为参考。

然而，要注意的是，尽管BY4741和S288C在基因组层面非常相似，但由于某些特定的基因敲除或突变，它们之间可能存在微小的差异。在大多数应用中，这些差异可能不会导致问题，但如果你的研究聚焦于特定的基因或基因区域，那么最好确认你的参考基因组与你的实验菌株之间不存在重大差异。