细菌初始浓度是多少开始加药孵育收集转录组样本,转录组的初始细菌浓度和抑菌实验的初始细菌浓度是一致的吗?

    在细菌学研究中,转录组实验和抑菌实验的初始细菌浓度有一定的区别,具体取决于实验的目的和研究重点。

     

    一、细菌转录组实验初始浓度

    1、初始细菌浓度

    (1)转录组实验一般要求细菌处于对数生长期 (Log Phase),因为这一阶段细菌的活性最高,基因表达较稳定。

    (2)常见的初始浓度:

    • OD₆₀₀ ≈ 0.4–0.6(对数生长期中期)
    • 或者约为 10⁷–10⁸ CFU/mL(菌落形成单位/毫升)

     

    2、加药时机

    (1)在细菌达到对数生长期的中期(如OD₆₀₀≈0.4–0.6)时,加入药物进行刺激。

    (2)加药后,孵育时间根据实验目的设定,常见时间点为15分钟、30分钟、1小时等。

     

    二、抑菌实验初始浓度

    1、初始细菌浓度

    (1)抑菌实验更注重初始细菌浓度的标准化,以便不同实验之间的可比性。

    (2)常见的初始浓度:

    • 5×10⁵–10⁶ CFU/mL(菌落形成单位/毫升)
    • 或者稀释至OD₆₀₀ ≈ 0.05–0.1

     

    2、加药时机

    (1)药物通常在细菌接种到新鲜培养基后立即加入。

    (2)通过动态监测细菌生长曲线(例如使用微孔板酶标仪)来判断药物的抑菌效果。

     

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    相关服务:

    转录组学和蛋白质组学整合分析

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