KEGG图如何分析?

    KEGG图是基因组、代谢组和信号传导网络的可视化表示。它由节点和边组成,节点代表基因、化合物或反应,边代表它们之间的关系。


    1.解读KEGG图的节点:

    • 节点可以是基因、代谢物或反应。了解节点的含义和功能是分析KEGG图的关键。
    • 对于基因节点,可以查找其注释信息,了解其命名、功能和调控机制。
    • 对于代谢物节点,可以查找其化学结构和代谢途径,了解其在生物系统中的作用。
    • 对于反应节点,可以了解其催化物和生成物,以及参与该反应的基因和代谢物。

    2.分析KEGG图的边:

    • 边表示节点之间的关系,可以是基因调控、代谢物转化或信号传导等。
    • 分析边的类型和方向可以揭示基因、代谢物和信号通路之间的相互作用和调控关系。
    • 可以通过计算节点之间的距离、度中心性等网络参数来评估节点的重要性和网络的稳定性。

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