求助:真菌测序ITS和18S有哪些区别?
ITS是真菌基因组中的一个高变区域,位于真核生物的核糖体基因组中的18S-5.8S-28S rRNA基因间区域。ITS序列通常包括ITS1和ITS2两个子区域,它们之间由5.8S rRNA序列连接。
18S rRNA是真菌核糖体基因组中的一个保守区域,它在真核生物中广泛存在,用于构建系统发育树和物种鉴定。
二者的区别:
1.变异程度:
ITS序列相对于18S rRNA序列来说更为变异。由于ITS序列在物种间变异较大,因此在物种鉴定和分类中具有更高的分辨率。而18S rRNA序列相对保守,适用于更广泛的系统发育分析。
2.物种鉴定:
由于ITS序列的高变异性,它在物种鉴定中更常用。ITS序列可以提供更多的信息,帮助区分不同的物种和亚种。而18S rRNA序列通常用于更宏观的分类和系统发育分析。
3.应用范围:
ITS序列在真菌领域的物种鉴定和分类中应用广泛,特别是在菌株鉴定和环境样品中的真菌多样性研究中。而18S rRNA序列则更常用于跨物种的系统发育分析,包括真菌与其他生物界的比较。
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