若关注环境中的真核微生物多样性，18S测序和ITS测序哪个更好？

在选择18S测序还是ITS测序时，需要考虑以下因素：




如果研究目标是对广泛的真核微生物群进行较高阶元的多样性和丰度评估，18S rRNA基因测序可能更适合。




如果目标是详细研究特定群体（如真菌）在物种或株级别的多样性和鉴定，那么ITS测序可能更有优势。




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