百泰派克生物科技BTP客户案例：利用N端Edman测序研究TseI自我剪切发生的位点
期刊：Nature communications；影响因子: 17.7632
原文链接：DOI: 10.1038/s41467-020-15774-z
研究对象：气单胞菌Aeromonas dhakensis
研究目的：T6SS分泌细菌Rhs蛋白的机制研究
研究手段：N端Edman测序等
研究内容及结论：细菌Ⅵ型分泌系统（T6SSs）能将一系列毒性效应物分子注射到细菌和真核受体细胞中去，含有毒性域的细菌Rhs（rearrangement hot spot）蛋白通常由T6SSs分泌，其机制尚不清楚。该研究发现气单胞菌Aeromonas dhakensis中的T6SS Rhs家族的效应因子TseI在N端和C端均可自我剪切，释放中间的Rhs核心和两个VgrG相互作用结构域（命名为VIRN和VIRC）。VIRC是一种核酸内切酶，免疫蛋白Tsil通过直接的相互作用保护机体免受VIRC的毒性。VIRC和VIRN的蛋白水解释放分别通过Rhs核心内的一种内部天冬氨酸蛋白酶活性和两个保守的谷氨酸残基介导。遗传突变实验发现，终止自我剪切的突变不会阻止分泌，但会降低TseI的毒性。VIRN或Rhs核心的缺失会阻止分泌。T6SS对VIRC的传递和共易位需要VIRN和Rhs核心。研究人员认为VIRN和Rhs核心作为T6SS分子内伴侣促进毒素的分泌和功能。
利用Edman降解法对纯化的TseI蛋白剪切产物的N端10个氨基酸序列进行测定，该服务由北京百泰派克生物科技提供。序列分析发现TseI的剪切发生在第420个半胱氨酸和第1433个亮氨酸后。
参考文献：Pei T T, Li H, Liang X, et al. Intramolecular chaperone-mediated secretion of an Rhs effector toxin by a type VI secretion system[J]. Nature communications, 2020, 11(1): 1865.
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