【送样指南】百泰派克蛋白组学、代谢组学样本量&样本采集及运输要求
一、送样量要求
1. 定性蛋白质组1.1. 常规定性蛋白质组
1.2. 互作定性蛋白质组
2. 蛋白质定量组
2.1. 常规蛋白质组（Label Free/DIA/TMT）
2.2. 修饰蛋白质组
2.3. 微量蛋白质组
3. 特殊蛋白质组
3.1. 化学蛋白质组（药靶）
3.2. 宏蛋白质组
3.3. 外泌体蛋白质组
4. 多肽组
5. 代谢组
5.1. 非靶代谢
5.2. 靶向代谢
二、样本收集指南
1. 样本采集&运输要求
（1）采集和运输过程中严格按照要求温度保存。同一份样本做多组学时，建议在取样环节进行分装，避免反复冻融；
（2）样本采集过程用水为超纯水，涉及有机试剂建议色谱纯级别以上；
（3）样本采集中使用离心管应为优质材料，装填样本后用足量封口膜缠好，避免过程中样本泄露或引入杂质（推荐品牌：Eppendorf，Axygen，Corning等）；
（4）由于部分仪器和软件不识别中文和特殊字符，样本名称尽量使用英文，如需字符可使用“_”；
（5）样本标记用油性记号笔标记，尽量标记多处，用减震材料包裹，避免低温运输过程中发生破损；
（6）使用双层泡沫盒运输样本，加入足量干冰。夏季需要 5kg 干冰/天，冬季需要 4kg 干冰/天，根据快递时效准备干冰。
2. 动物组织样本
2.1. 常规动物组织（脑、心、肝、脾、肾、肺等）
（1）准确切取所需组织后，迅速剔除脂肪和结缔组织等非研究所需的组织类型，将组织分割成 20-50 mg 小块（约黄豆大小）；
（2）在生理盐水或 PBS 中迅速漂洗样本，以去除血渍和污物；
（3）用镊子夹住样本转移至提前标记好的离心管中，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（4）干冰寄送，避免反复冻融。
注：肿瘤组织要根据病理条件切块，癌旁组织远离病灶 2cm 以上。
2.2. 坚硬动物组织（骨头、软骨等）
（1）PBS 洗涤，用手术刀将软骨切成 1cm3 左右的小块；
（2）转移至有标记的离心管中，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（3）干冰寄送，避免反复冻融。
2.3. 坚硬动物组织（毛发）
（1）用适量 2% SDS，50mM 磷酸钠（pH7.8）缓冲液漂洗样品，去除污染物；
（2）干燥样本，转移至有标记的离心管中，-80℃保存；
（3）干冰寄送，避免反复冻融。
2.4. 软体动物 (血吸虫、旋毛虫等)
（1）收集样本，用预冷的 PBS 去除宿主污染物；
（2）转移至有标记的离心管中，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（3）干冰寄送，避免反复冻融。
3. 植物组织样本
3.1. 常规植物组织（叶、花、果实、种子、树根、树皮等及蕨类等）
（1）取特定部位组织，去除非目标组织，冲洗掉尘土和明显杂质，无尘纸擦干；
（2）锡纸包裹或者放入离心管，做好标记后液氮速冻 10min，-80℃保存；
（3）干冰寄送，避免反复冻融。
3.2. 花粉
（1）植物开花期收集花粉，解剖显微镜下检查花粉，用解剖针去除花药碎片等杂质，转入 EP 管中；
（2）光学显微镜下检查花粉的形态和纯度，-80℃保存；
（3）干冰寄送，避免反复冻融。
3.3. 藻类
（1）根据不同的藻类采取合适的离心力，分离藻类同时保证细胞完整，PBS 洗涤 2-3 次，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（2）干冰寄送，避免反复冻融。
4. 细胞样本
4.1. 悬浮细胞
（1）1000 g，离心 10 min，收集悬浮细胞，弃培养上清；
（2）用预冷的 PBS 溶液洗 2-3 遍，离心弃上清，收集细胞沉淀于 1.5mL 离心管中；
（3）液氮速冻 10min，-80℃保存；
（4）干冰寄送，避免反复冻融。
4.2. 贴壁细胞
（1）弃培养基，将培养皿倒扣至吸水纸上，将液体控干；
（2）加入 4℃预冷的 PBS，平放轻轻摇动 1min 洗涤细胞，弃去 PBS。 重复以上两步操作 2 次以弃去培养液；
（3）将培养皿置于冰上，胰蛋白酶消化后，加入预冷的 PBS 重悬细胞；
（4）将细胞悬液收集到 15 mL 离心管中，4℃，1000 g 离心 10 min，弃除PBS；
（5）1mL PBS 重悬细胞后转移到新的 1.5 mL 离心管中，离心弃除 PBS，保留细胞沉淀，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（6）干冰寄送，避免反复冻融。
5. 液体类样本
5.1. 血清
（1）使用真空采血管收集血液（不含抗凝剂，推荐红盖）或收集全血到洁净的离心管中；
（2）轻柔上下颠倒混匀 8-10 次，4℃，静置 30 min；
（3）4℃，1000 g 离心 10 min；
（4）用移液器将上层淡黄色血清转移到离心管中，混匀，瞬时离心；
（5）按照实验需求分装 100-200μL/管，液氮速冻 10min，- 80℃保存；
（6）干冰寄送，避免反复冻融。
5.2. 血浆
（1）使用真空采血管收集血液（含抗凝剂，推荐紫盖，含 EDTA 抗凝剂）或收集全血到含抗凝剂的离心管中；
（2）轻轻地上下颠倒混匀 8-10 次；
（3）4℃，1000 g 离心 10 min；
（4）用移液器将上层淡黄色血清转移到离心管中，混匀，瞬时离心；
（5）按照实验需求分装 100-200μL/管，液氮速冻 10min，- 80℃保存；
（6）干冰寄送，避免反复冻融。
注：血清/血浆样本采集时保证动作轻柔，避免溶血。样本颜色为澄清透亮的黄色，如发现有粉色或红色，证明存在溶血污染，对后续结果有一定影响。
5.3. 尿液样本
（1）采集受试者晨起后的中段尿液，于 4℃临时保存（不得超过 8 h），注意避免细菌污染，收集前注意对饮食的控制；
（2）4℃，1000 g 离心 15min，去除细胞或细胞碎片；
（3）取上清至新的离心管中，分装 1mL/管，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（4）干冰寄送，避免反复冻融。
5.4. 乳汁、腹水
（1）按照临床采集方法，采集乳汁、腹水样本于离心管中；
（2）按照实验需求分装 1mL/管，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（3）干冰寄送，避免反复冻融。
5.5. 脑脊液、淋巴液、关节液、穿刺液
（1）按照临床采集方法，采集样本于离心管中；
（2）4℃，1000g~2000 g 离心 5min；
（3）取上清使用 0.22μm 滤膜（可选）过滤，收集流穿液；
（4）按照实验需求分装 100μL/管，液氮速冻 10min，-80℃保存。
5.6. 唾液样本
（1）禁食两小时以上，9-12 a.m.时段取样；
（2）4℃，1000g~2000 g 离心 5min；
（3）取上清使用 0.22μm 滤膜（可选）过滤，收集流穿液；
（4）按照实验需求分装 100-200μL/管，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（5）干冰寄送，避免反复冻融。
5.7. 泪液样本
（1）使用毛细管微量移液管收集样品，4℃，8000-14000 g 离心 5min；
（2）取上清至离心管中，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（3）干冰寄送，避免反复冻融。
5.8. 细胞培养基上清
（1）参考细胞收集方法，去除原有培养基，收集细胞；
（2）使用无血清培养基继续培养细胞。细胞继续培养 24-48 小时（根据细胞的生长速度确定收取上清时间）；
（3）300 g，4°C，离心 10 min，取上清至 15mL 离心管中；
（4）4°C，3000 g，离心 15 min，去除多余的细胞碎片；
（5）将上清样本转移至新的离心管中，分装 5-10mL/管，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（6）干冰寄送，避免反复冻融。
注：含血清的培养基会在后续实验中引入高丰度蛋白，导致鉴定数量大量降低。
6. 微生物
（1）4℃，5000g 离心 15min，弃上清；
（2）用预冷的 PBS 重悬菌体沉淀，再次离心弃上清，重复 3 次；
（3）收集菌体沉淀至新的离心管中，按照实验需求分装 50-100μL/管，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（4）干冰寄送，避免反复冻融。
7. 粪便、肠道内容物
7.1. 粪便
（1）粪便排出后，使用取样勺取中段转移至有标记的离心管中；
（2）按照实验需求对样品进行分装，每管均为100~500 mg，液氮速冻10min，-80℃保存；
（3）干冰寄送，避免反复冻融。
7.2. 肠道内容物
（1）取出整个肠道，切取目标区域肠道，纵向切开肠道，使肠道内容物暴露出来；
（2）使用无菌取样器收取肠道内容物到有标记的离心管中（尽可能取到到肠道深处，但避免取到肠道表皮组织和血液等杂质）；
（3）按照实验需求对样品进行分装，每管均为100~500 mg，液氮速冻10min，-80℃保存；
（4）干冰寄送，避免反复冻融。
8. 环境样本
8.1. 土壤
（1）挖取地下 5~20cm 的土层，去除可见杂质；
（2）土壤过 2mm 筛网，分装 5-10g/管到新的离心管中，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（3）干冰寄送，避免反复冻融。
8.2. 水体
（1）采集所需水体样本，静置 24h，弃除污泥等大颗粒杂志；
（2）取上清过 0.22μm/0.45μm 滤膜，保留滤膜，-80℃冻存；
（3）干冰寄送，避免反复冻融。
注：
①0.45μm 截取真菌及直径更大的微生物，0.22μm 截取细菌及直径更大的微生物，客户根据研究目的选取对应的滤膜；
②滤膜冷冻后变脆易碎，建议样本收集后尽快开展实验。
9. 发酵物残渣（大曲、酒醅、作物等）
（1）收集样本，分装 2-5g/管至离心管中，-80℃保存；
（2）干冰寄送，避免反复冻融。
How to order?
