PLS-DA/OPLS-DA二维图是用什么软件做的

PLS-DA/OPLS-DA二维图通常是通过专业的统计和数据分析软件生成的。常用的软件工具主要包括：

 

1.R 语言：

R 语言是一个强大的统计计算和图形化软件，通过使用“mixOmics”包或“ropls”包等，它可以执行PLS-DA和OPLS-DA分析，并生成二维图。

 

2.MetaboAnalyst：

这是一个在线工具，提供了一系列用于代谢组学数据分析的复杂工具，包括偏最小二乘判别分析（PLS-DA）和正交偏最小二乘判别分析（OPLS-DA）。

 

3.SIMCA：

这是一款由Sartorius Stedim Biotech开发的专业多变量分析软件，专门用于多元数据分析，如PCA（主成分分析）、PLS-DA和OPLS-DA。它可以创建详细的统计模型，并生成易于解释的图形结果，如二维得分图或负荷图。

 

4.MATLAB：

MATLAB是一种用于算法开发、数据分析、可视化和数值计算的高级语言和交互式环境。通过特定的工具箱和函数，可以执行OPLS-DA分析。

 

5.Python：

Python是一种编程语言，提供了多种库（如scikit-learn、PyChem、pandas等）来进行复杂的数据分析。通过如scikit-learn、matplotlib等库，Python也可以用来进行OPLS-DA分析和绘图，尽管它可能不如其他专用工具那么直观。

 

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