多肽在质谱里的m/z计算
一、多肽在质谱里的m/z计算
在质谱分析中，m/z是一个非常重要的参数，它代表质荷比。质谱图表上的每一个峰都代表一个离子，而该离子的m/z值就是其质量和电荷的比值。这里的z通常是+1或-1，这是因为大多数离子只携带一个电荷。然而，在某些情况下，离子可能会携带两个或更多的电荷。这对于大型分子，如蛋白质和多肽，特别重要，因为这样的分子可能会通过多次电荷而成为离子。
对于多肽的m/z计算，我们需要考虑到其中的氨基酸残基以及可能存在的修饰。每个氨基酸残基的质量可以从氨基酸的质量表中查到，而修饰的质量则需要从相关的文献中查到。此外，我们还需要考虑到离子的类型。对于多肽离子，常见的类型有b离子和y离子，它们分别对应从N端和C端断裂的离子。
二、多肽m/z计算的步骤
计算多肽的质量。这可以通过将所有氨基酸残基的质量以及可能的修饰质量相加得到。注意，这是不带电荷的质量。在上一步得到的质量中，加上或减去离子携带的电荷。在大多数情况下，这是一个质子的质量（约为1.007 Da）。得到的值就是m/z。
例如，考虑一个含有丝氨酸（S，质量为87.078 Da）、酪氨酸（Y，质量为163.176 Da）和苯丙氨酸（F，质量为147.177 Da）的三肽，并且从N端断裂得到一个b离子。这个离子的质量就是87.078 + 163.176 = 250.254 Da。如果这个离子携带一个电荷，那么其m/z就是250.254 + 1.007 = 251.261。注意，这只是一个简化的计算方法。在实际的质谱分析中，由于离子化的方式、可能存在的碎片离子以及其他因素的影响，可能需要更复杂的计算方法。
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