IP后做蛋白质谱
免疫沉淀(Immunoprecipitation, IP)是一种纯化蛋白质的方法。其原理是将目的蛋白的抗体与样品提取液孵育,使抗体和蛋白质在溶液中结合。然后用细菌蛋白protein A/G 耦合的琼脂糖凝胶,从样品中将抗体/抗原复合物提取出来。
图1 免疫沉淀技术的原理
IP主要是有选择性地捕获目标蛋白质及其相互作用的蛋白质,要想对这些蛋白质进行量化,还需要其他技术的配合。近年来随着质谱技术(MS)的发展,将MS联合其他技术用于蛋白质的研究已成为一种普遍趋势。
在IP后进行质谱分析,可以进一步对富集到的蛋白质进行鉴定和定量,其过程是先将IP得到的蛋白质复合物进行蛋白质裂解和消化,得到一系列蛋白质片段(肽段)。然后利用质谱仪对蛋白酶解后的肽段混合物进行电离、分离和检测,通过分析肽段的质荷比(m/z)和质谱数据,实现对蛋白质的定性和定量分析。
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