高通量基因敲除后代谢组学分析
代谢组学通过定量测量细胞内的代谢物可以提供关于生物状态的独特视角，作为系统生物学的一个关键分支，其致力于分析和解释生物体内所有代谢物的综合集合。借助质谱（MS）和核磁共振（NMR）等核心技术，我们可以精准地测量和比较不同条件下的代谢物变化，从而深入理解疾病机制和物质代谢路径。随着科技的进步，尤其是高通量基因敲除技术的发展，如CRISPR-Cas9系统的应用，我们现在能够在更细致的层面上探索基因如何影响细胞的代谢过程。
高通量基因敲除技术使得在多种细胞类型和生物模型中同时敲除数百甚至数千个基因成为可能，借助该技术我们可以快速构建大量基因敲除细胞株，从而在系统层面上分析基因功能和基因网络。结合代谢组学质谱技术，研究人员能够分析敲除特定的代谢相关基因后细胞或组织中代谢产物的组成及丰度等变化，研究特定基因对代谢通路的影响，在全基因组水平上理解基因如何调控细胞代谢。例如，敲除特定的代谢相关基因后，可以观察到细胞内特定代谢物的变化，从而揭示这些基因在代谢途径中的作用。
百泰派克生物科技（BTP）基于高分辨率代谢组学分析平台，结合高通量基因敲除技术，可以为您提供从基因敲除到代谢组分析的一站式解决方案。我们优化的CRISPR/Cas9系统可实现人/小鼠细胞系、原代细胞、免疫细胞及iPS细胞的单/多基因敲除、移码突变和大序列敲除。获得KO细胞后对其进行培养并提取KO细胞产生的代谢物，利用高分辨液质联用平台（LC-MS、GC-MS）以及核磁共振平台进行代谢组分析，鉴定代谢物种类及水平的变化，揭示特定敲除基因对代谢网络的影响。BTP自建7大检测平台，拥有CNAS/ISO9001双重质量体系认证实验室，旨在为您提供最优质的科研服务，我们期待与您的合作，欢迎免费联系我们，了解更多服务详情！
服务优势
1）敲除效率保证：优化的CRISPR/Cas9系统，超过80%靶点敲除效率在70%；基因敲除后，我们采用Sanger测序和深度蛋白质组学技术对敲除效率进行双验证，双重保障数据的真实性。
2）完善的代谢组学分析平台：我们的代谢组学分析平台配备完善的样品前处理仪器（包含细胞破碎仪、组织破碎仪、组织研磨仪等）、超高效液相色谱高分辨质谱联用（Orbitrap Exploris 240 & Orbitrap Exploris 480 With FAIMS Pro），可实现组学水平上代谢物的高效提取、定性鉴定和相对定量（3D & 4D）、绝对定量分析。
3）项目周期短：在进行基因敲除实验前，我们会对不同细胞中基因必要性及表达量进行分析，确保实验的可行性，降低实验失败风险；且无需针对客户的靶点设计预实验进行gRNA验证，大大缩短了项目周期。
4）一站式服务：BTP拥有丰富的组学服务经验以及专业的技术人员，可以根据您的需求定制最优的项目方案，您只需将您的实验目的告诉我们并寄送样品，BTP负责所有项目后续，包括样品处理、实验分析、数据分析和项目报告。
应用案例
溶质载体 OCTN1 (SLC22A4) 是一种独立转运蛋白，其生理上重要的底物仍未确定。为了研究OCTN1 的生理作用。研究人员首先构建了溶质载体OCTN1基因敲除（octn1-/-）小鼠，然后通过代谢组分析以鉴定体内的底物。结果发现，octn1-/-小鼠的血液和几种器官中缺乏一种天然的强效抗氧化剂——鸟嘌呤。这项研究揭示了OCTN1在维持体内和肠道鸟嘌呤暴露中的关键作用，可能对预防肠道组织损伤很重要，也为诊断炎症性肠病提供了一种可能的方法。
Kato Y,et al.,Pharm Res.
相关服务
How to order?
