10X单细胞测序是不是只测3'UTR的那部分？

10X单细胞测序技术基于GEM（Gel Bead in EMulsion）技术，将单个细胞与一系列的微滴中的琼脂糖珠（gel bead）一起封装在油水混合物中。每个琼脂糖珠上都有一种特定的条形码，用于标记来自同一细胞的RNA分子。细胞在微滴中被裂解，RNA与琼脂糖珠上的条形码进行反应，形成RNA-条形码复合物。复合物经过逆转录和扩增，生成cDNA，然后进行测序。

10X单细胞测序技术主要关注的是mRNA的转录本，而不是特定的区域，如3'UTR。在cDNA合成过程中，使用的是一种称为oligo-dT的引物，它可以选择性地逆转录mRNA的poly(A)尾部。因此，10X单细胞测序可以捕获到mRNA的全长，包括5'端、CDS（Coding Sequence）和3'端。

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