化学蛋白质组学
化学蛋白质组学(Chemical Proteomics)作为蛋白质组学的一个重要分支,整合了合成化学、细胞生物学和质谱学多种方法,旨在设计小分子探针以了解药物发现中的小分子作用模式和蛋白质功能,在天然产物的背景下,化学蛋白质组学可用于识别活细胞中小分子的蛋白质结合伴侣或靶标。化学蛋白质组学由两个关键步骤组成:(1)探针设计和合成;(2)目标捕捞和蛋白质鉴定。目前已经开发了4种不同类型的探针以筛选具有不同结构的小分子靶标;打靶之后,也有多种蛋白质鉴定方法,适合不同的情况。化学蛋白质组学为靶点反卷积、药物反应生物标志物的发现以及用于临床前靶点验证的疾病途径分析提供了一系列新颖的方法,在药理学研究领域,已广泛用于识别药物靶点并研究其作用机制。
化学蛋白质组的应用
百泰派克生物科技(BTP)采用高分辨质谱平台开发并验证了尖端的化学蛋白质组学技术,可用于生物标志物研究、药物和靶点发现、通路建模、作用机制研究等众多领域,旨在为客户提供优质、全面的靶点解卷积服务。我们提供多种方法来识别和验证新药物靶点,以满足不同的需求。
设计和合成探针是化学蛋白质组学方法中靶标识别的初始和关键步骤。BTP提供常用的四种探针,包括(1)固定化探针:将生物活性天然产物被共价固定在生物相容性惰性树脂上(如琼脂糖和磁珠),例如琼脂糖和磁珠,作为筛选活性蛋白质组中目标蛋白的诱饵;(2)基于活性的探针(ABP):ABP考虑了药物分子的活性,在富集前可以与活性蛋白质组中的蛋白质相互作用,甚至可以穿过细胞膜与活细胞中的靶蛋白结合,潜在地反映了细胞内生理条件下真实的药物与靶点的相互作用;(3)点击化学探针:此类探针通过与其互补体(如叠氮化物、炔烃等)进行生物正交点击反应,从而将探针共价连接到亲和标签(生物素-叠氮化物、生物素-环丙烷等)或荧光标签(罗丹明-叠氮化物、FITC-叠氮化物等)上,用于后续富集和目标鉴定;(4)光亲和探针:光亲和探针由点击化学探针骨架和用于固定探针与靶标之间结合的光亲和基团组成,在特定波长光的照射下,光亲和基团会产生高活性自由基促使活性分子与靶标共价结合。
Chen, X.; et al. Sig Transduct Target Ther. 2020.
不同类型化学蛋白质组学探针的一般分子结构
对于一些没有适合修饰位点或修饰后影响活性的天然产物,BTP也提供基于药物亲和力响应靶点稳定性(DARTS)和热分析蛋白质组分析(TPP)的非标记化学蛋白质组学方法。DARTS依赖于通过与小分子相互作用赋予靶蛋白的蛋白水解保护,首先用目标化合物和载体对照或无活性类似物简单处理细胞裂解物的等分试样,然后用蛋白酶有限消化细胞裂解物中的蛋白质,随后通过 SDS-PAGE 分离样品并染色,以鉴定免受小分子蛋白水解的蛋白质条带最后使用 MS 来识别每个条带中存在的蛋白质。
Chen, X.; et al. Sig Transduct Target Ther. 2020.
非标记化学蛋白质组学方法流程
百泰派克生物科技化学蛋白质组学全面解决方案包括从实验设计、样品制备、探针合成、靶标鉴定以及数据分析的全流程,为您提供一站式的无忧服务,满足您在药物开发和药物发现领域生物标志物研究、药物和靶点发现、通路建模、药物作用研究等的多种需求。借助我们全面的解决方案,您不会在错误的候选药物上浪费时间和成本,并且能够优化药物开发和药物发现计划的成功率。欢迎免费咨询,了解更多服务详情!
中/英文项目报告
在技术报告中,百泰派克会为您提供详细的中英文双语版技术报告,报告包括:
1. 实验步骤(中英文)
2. 相关的质谱参数(中英文)
3. 化学蛋白质组学详细信息
4. 质谱图片
5. 原始数据
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