蛋白质定量标签规格是什么
蛋白质定量标签,如Tandem Mass Tag(TMT)和Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation(iTRAQ),是用于质谱分析中的化学标签,它们允许同时定量比较多个样本中的蛋白质表达。这些标签通过共价键连接到样本中的肽段上,然后在质谱分析过程中通过释放一个标记离子来进行检测和定量。
蛋白质定量标签的常见类型包括:
1、TMT标签
每个TMT标签包含三个部分:一个质量报告基团(质量不同,用于检测和定量)、一个平衡基团(确保所有标签的总质量相同,以实现等离子异位质谱法的分析)、一个反应基团(与肽段的氨基端或赖氨酸侧链反应)。
图1.TMT试剂的化学结构通式
TMT标签规格:TMT标签有多种规格,包括TMT0、TMT2plex、TMT6plex、TMT10plex、TMT11plex和最近开发的TMT16plex和TMTpro系列。数字指的是每个标签套装可以标记的不同样本数,例如TMT10plex可以用于同时比较10个不同的样本。
2、iTRAQ标签
iTRAQ标签也包含报告基团、平衡基团和反应基团。iTRAQ标签通过与肽段的N末端和赖氨酸侧链的氨基反应,将标签附加到肽段上。
图2. iTRAQ试剂的化学结构
iTRAQ标签规格:iTRAQ标签通常有4plex和8plex两种规格,允许同时定量分析四个或八个样本。
每种类型的标签有其特定的规格,如反应条件、标记效率、质谱检测的灵敏度等。这些规格对于实验的设计和数据的解释至关重要。例如,同位素标签需要具备足够的质量差异以便在质谱中区分,而化学标签则需要有高的标记效率和稳定性。
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