数据的完整性和准确性是后续获得具有统计学和生物学意义的分析结果的必要条件。在确保实验设计的合理性和实验数据的准确性的基础上，百泰派克首先对数据的完整性进行检查，对缺失值进行删除或者补充，删除极值，并对数据进行样本间和代谢物间的归一化处理，以确保各样本之间和代谢物之间可平行比较。原始数据中，缺失值超过50%的代谢物将被去除，不参与后续分析；对代谢物的表达量进行对数转换并利用Autoscaling方法（Mean-centered and divided by the standard deviation of each variable）进行归一化处理。下图显示了正离子模式数据经归一化处理前后的分布情况，结果表明数据经归一化处理后基本呈正态分布。
