组蛋白修饰的类型
组蛋白修饰是一种重要的表观遗传调控机制,通过在组蛋白的特定氨基酸残基上添加或移除不同的化学基团来实现。这些修饰可以影响染色质的结构和功能,进而调控基因的表达。目前至少已发现九种不同类型的组蛋白修饰。乙酰化、甲基化、磷酸化和泛素化是人们最了解的,而糖基化、瓜氨酸化、巴豆酰化、类泛素化和异构化是较新的发现,尚未得到彻底研究。这些修饰中的每一个都是通过一组特定的酶在组蛋白氨基酸残基上添加或去除的。
图1. 最常见的组蛋白修饰
这些组蛋白修饰共同构成了所谓的组蛋白密码,它决定了局部基因组区域的转录状态。检查特定区域或整个基因组的组蛋白修饰可以揭示基因激活状态、启动子、增强子和其他基因调控元件的位置。
1.乙酰化(Acetylation):
乙酰化是研究最广泛的组蛋白修饰之一,因为它是最早发现影响转录调控的组蛋白修饰之一。乙酰化通常发生在组蛋白的赖氨酸残基上,由组蛋白乙酰转移酶(HATs)催化。组蛋白乙酰化参与细胞周期调节、细胞增殖和细胞凋亡,并可能在调节许多其他细胞过程中发挥重要作用,包括细胞分化、DNA 复制和修复、核输入和神经元抑制。组蛋白乙酰化平衡的不平衡与肿瘤发生和癌症进展相关。
2.甲基化(Methylation):
甲基化可以发生在赖氨酸或精氨酸残基上,由组蛋白甲基转移酶(HMTs)催化。根据甲基化的位置和程度(单甲基化、双甲基化或三甲基化),它可以激活或抑制基因表达。
3.磷酸化(Phosphorylation):
组蛋白磷酸化是细胞分裂、转录调控和 DNA 损伤修复过程中染色体凝聚的关键中间步骤。与乙酰化和甲基化不同,组蛋白磷酸化在其他组蛋白修饰之间建立相互作用,并充当效应蛋白的平台,从而导致下游级联事件。
4.泛素化(Ubiquitination):
所有组蛋白核心蛋白都可以被泛素化,但 H2A 和 H2B 最常见,也是细胞核中泛素化程度最高的两种蛋白。组蛋白泛素化在 DNA 损伤反应中发挥着核心作用。
5.类泛素化(Sumoylation):
类泛素化涉及将一个小的泛素相关修饰剂(SUMO)添加到组蛋白上,通常与核质内运输和基因沉默有关。
6.糖基化(Glycosylation):
虽然不常见,组蛋白也可以经历糖基化修饰,这种修饰对核内信号传导和细胞核结构可能有影响。
这些修饰通常是可逆的,由特定的酶进行添加和移除,反映了表观遗传学中的动态和复杂性。组蛋白修饰的模式和组合对细胞功能有深远的影响,是细胞应对环境变化和调控发育过程的重要机制。
图2. 组蛋白翻译后修饰鉴定研究路线
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